Pour optimiser l’exactitude du diagnostic, il est important de veiller, pour chaque type d’échantillon, à ce que le prélèvement soit effectué correctement et qu’il soit de bonne qualité.
Échantillons de liquide d’aspiration gastrique. Le prélèvement d’échantillons d’aspiration gastrique chez les enfants requiert un personnel formé et l’accès à un certain type de matériel. Il peut également nécessiter une hospitalisation et donc ne pas être réalisable aux premiers niveaux du système de santé. Il est considéré comme une procédure invasive, nécessite que l’enfant soit à jeun et peut être désagréable et moins acceptable pour les enfants et les personnes qui s’en occupent, ou avoir des effets indésirables. Les systèmes de référence doivent être opérationnels pour garantir que les enfants chez qui un test doit être réalisé sur des échantillons gastriques pourront accéder au niveau de soins approprié.
Échantillons de selles. Le prélèvement de selles a l’avantage de ne pas être invasif, sa réalisation étant généralement considérée comme facile et faisable par les agents de santé et les personnes qui s’occupent de l’enfant, quel que soit son état clinique. L’inconvénient éventuel est que l’enfant risque de ne pas produire de selles sur commande, ce qui peut retarder l’obtention de l’échantillon. Pour améliorer l’acceptabilité et la mise en oeuvre, il est important de sensibiliser les personnes qui s’occupent des enfants au fait que les selles constituent des échantillons appropriés pour la recherche de la tuberculose. La préparation des échantillons de selles est également une procédure acceptable pour les techniciens de laboratoire, et les échantillons de selles sont considérés comme une bonne alternative aux échantillons d’expectorations. Des taux relativement élevés de résultats de tests Xpert Ultra indéterminés (comprenant les résultats erronés ou non valides, ou l’absence de résultats) ont été signalés dans les études incluses dans la revue systématique. Ces taux variaient de moins de 1 % à 10 %, et peuvent dépendre de la méthode utilisée pour la préparation des échantillons de selles.
Méthodes de préparation des échantillons de selles. Une analyse des résultats préliminaires d’une comparaison directe de trois méthodes de préparation des selles sans centrifugation combinées à un test Xpert Ultra a été réalisée pour obtenir des informations susceptibles de guider la mise en oeuvre de l’utilisation de ce test réalisé sur des échantillons de selles. Les trois méthodes de préparation utilisées étaient la méthode de flottaison optimisée dans une solution de saccharose (OSF) (28), la méthode simple en une étape (SOS) (29) et le kit de préparation des selles (SPK) (25). Lorsque le GDG s’est réuni, les résultats ont montré que la performance du test Xpert Ultra était similaire avec les trois méthodes de préparation des selles, aussi bien en termes de sensibilité que de spécificité. Toutes ces méthodes ont été jugées faciles à utiliser par le personnel du laboratoire de référence et ont obtenu un score élevé en termes de facilité d’utilisation. Cependant, la plupart des utilisateurs ont estimé qu’aucune de ces méthodes ne pouvait être pratiquée par du personnel autre que du personnel de laboratoire (tel que personnel infirmier ou agents de santé) dans les établissements de SSP sans accès à un laboratoire. Dans l’ensemble, la préférence est allée à la méthode SOS parce qu’elle ne nécessite pas d’équipement supplémentaire et qu’elle est comparable à la méthode de préparation des expectorations pour la réalisation d’un test Xpert Ultra. Le SPK est encore au stade de prototype, mais ne sera pas commercialisé ; l’OSF est encore en cours de validation, et son adaptation sous forme de kit permettant de simplifier certaines étapes est envisagée dans un avenir proche. Par conséquent, l’une ou l’autre des méthodes disponibles de préparation des selles sans centrifugation peut être utilisée, en fonction des préférences locales et des infrastructures de laboratoire disponibles.
Résultats du test Xpert Ultra indiquant la présence de traces. Les résultats indiquant la présence de traces sont fréquents avec l’utilisation du test Xpert Ultra chez les enfants, quel que soit le type d’échantillon utilisé, ce qui témoigne de la nature paucibacillaire de la tuberculose dans cette tranche d’âge. Lors de la recherche d’une tuberculose pulmonaire chez des enfants ou des personnes vivant avec le VIH, et de la recherche d’une TEP quelle que soit la population, l’obtention d’un résultat « M. tuberculosis complex (MTBC) detected trace » (détection de traces du complexe M. tuberculosis) à un test Xpert Ultra est considéré comme la confirmation bactériologique de la présence d’une tuberculose (30). Il est important de prendre cet élément en considération lors de la mise en oeuvre, le risque de morbidité et de mortalité étant particulièrement élevé dans ces populations. Les résultats faisant état de la présence de traces sont considérés comme des résultats indéterminés pour la résistance à la rifampicine. Lorsqu’une personne a une forte probabilité de pharmacorésistance, il peut donc être nécessaire de prélever d’autres types d’échantillons et de les préparer en vue de la réalisation d’un test Xpert Ultra.