Les échantillons cliniques recommandés par l’OMS pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire chez les enfants et les adolescents à l’aide d’un test Xpert MTB/RIF ou Ultra comprennent les expectorations (simples ou induites), le liquide d’aspiration gastrique, le produit d’aspiration nasopharyngée et les selles. Les autres TDMRO réalisés sur des échantillons des voies respiratoires n’ont été validés que sur des échantillons d’expectorations. Chacun de ces différents types d’échantillons présente des avantages et des inconvénients spécifiques (Tableau 4.1). Un récapitulatif des différents types d’échantillons des voies respiratoires et d’échantillons autres que ceux des voies respiratoires est disponible à l’annexe 3. Les modes opératoires normalisés pour les méthodes les plus courantes de collecte d’échantillons sont présentés à l’annexe 4.
Les enfants plus âgés et les adolescents ont souvent une tuberculose de type adulte (avec la présence de cavités à la radiographie thoracique) et des résultats positifs aux tests bactériologiques. Dans ces tranches d’âge, la collecte d’expectorations spontanées est possible, généralement à partir de l’âge de 8 ans environ, parfois aussi chez des enfants plus jeunes
Le choix du type d’échantillon dépend des éléments suivants :
- L’acceptabilité pour l’enfant, les parents, les agents de santé et les autres parties prenantes ;
- La faisabilité de la collecte et de la préparation des échantillons dans le contexte local ;
- La disponibilité des tests au niveau local.
Selles
Les selles sont un type d’échantillon nouvellement recommandé pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire chez les enfants à l’aide d’un test Xpert MTB/RIF ou Ultra (3, 26). Elles peuvent être utilisées comme une alternative, notamment dans les situations où il est difficile d’obtenir des échantillons des voies respiratoires adéquats pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire, en particulier chez les jeunes enfants. La réalisation de tests sur des selles peut s’avérer plus acceptable et plus facilement réalisable dans certaines situations, car le mode de prélèvement des selles est moins invasif que celui utilisé pour l’obtention de liquide d’aspiration gastrique ou de produit d’aspiration nasopharyngée.
Les enfants atteints de tuberculose avalent des expectorations contenant des bacilles tuberculeux provenant des poumons, lesquels passent ensuite dans le tube digestif et pourront être détectés dans les échantillons de selles. Les selles sont donc considérées comme un échantillon des voies respiratoires pour le diagnostic de la tuberculose.
Selon les données disponibles, les expectorations (induites ou simples) et le liquide d’aspiration gastrique sont les types d’échantillons qui permettent d’obtenir le meilleur rendement de détection, mais la précision diagnostique des tests Xpert MTB/RIF (73) et Ultra (annexe 4 disponible sur le Web) effectués sur des échantillons de selles est similaire à celle des tests effectués sur d’autres types d’échantillons des voies respiratoires chez les enfants (Tableau 4.2) ; cette méthode présente en outre l’avantage non négligeable de ne pas être invasive. L’utilisation d’échantillons de selles requiert une étape de préparation préalable à l’insertion de l’échantillon dans la cartouche Xpert. Différentes méthodes de préparation des selles ont été mises au point pour la réalisation de tests Xpert MTB/RIF et Ultra, notamment la flottation optimisée sur saccharose et la méthode simple en une étape (SOS) pour préparation des selles (voir le Tableau 4.3).
Ces deux méthodes peuvent être utilisées pour la préparation des selles, mais les données préliminaires suggèrent que la méthode SOS est la plus facile à mettre en oeuvre dans les laboratoires des premiers niveaux du système de santé et qu’elle a le meilleur rapport coût-efficacité, tout en garantissant une précision diagnostique satisfaisante (74) (voir l’annexe 4 disponible sur le Web).
Les documents suivants concernant les méthodes de préparation des selles sont disponibles :
- Practical manual of processing stool samples for diagnosis of childhood TB (https://www.who.int/publications/i/item/9789240042650) ;
- KNCV SOS Stoolbox (https://www.kncvtbc.org/en/sos-stoolbox/) ;
- Ressources et outils TB-speed (https://www.tb-speed.com/fr/resources/).
Produit d’aspiration nasopharyngée
L’aspiration nasopharyngée est une procédure relativement simple, moins invasive que l’aspiration gastrique, et qui présente un risque de transmission nosocomiale plus faible que celui associé à la collecte d’expectorations induites (75). Elle peut être utilisée chez les enfants incapables de produire spontanément des expectorations dans des situations où il n’est pas possible de recourir à des procédures plus invasives. L’enfant doit être à jeun depuis 2 heures avant de réaliser la procédure. L’aspiration nasopharyngée consiste, alors que l’enfant est allongé, à effectuer une aspiration au
niveau de son nasopharynx à l’aide d’une sonde stérile insérée dans l’une de ses narines et équipé d’un piège à mucus ou d’un dispositif de prélèvement.
Des informations supplémentaires et les modes opératoires normalisés de collecte des différents types d’échantillons se trouvent à l’annexe 4.
Des informations détaillées sur d’autres méthodes de collecte d’échantillons sont disponibles à l’annexe 4