Es necesario dar seguimiento y evaluar la repercusión que tienen los algoritmos integrados de decisión sobre el tratamiento en las notificaciones de casos y los resultados del tratamiento.
De igual importancia es el seguimiento clínico de los pacientes que iniciaron el tratamiento de la TB con base en criterios clínicos y la necesidad de supervisar la respuesta al tratamiento (con el fin de reconocer un diagnóstico diferente en los casos cuyo diagnóstico de TB pudo haber sido errado), los eventos adversos y el deterioro del estado clínico.